Căn cứ Điều 12 Nghị định 252/2026/NĐ-CP, Người nộp thuế được phép kê khai bổ sung khi phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai sót, nhầm lẫn làm ảnh hưởng đến số thuế phải nộp, số thuế được khấu trừ, số thuế đề nghị hoàn hoặc các chỉ tiêu khác trên tờ khai thuế. Việc khai bổ sung hồ sơ khai thuế từ ngày 01/7/2026, Người nộp thuế cần lưu ý:
1.Các trường hợp không phải khai bổ sung hồ sơ khai thuế:
Căn cứ Thông tư 89/2026/TT-BTC, từ ngày 01/07/2026, có 05 trường hợp người nộp thuế phát hiện sai sót hoặc có biến động về thuế GTGT đầu vào nhưng không phải khai bổ sung hồ sơ khai thuế mà được kê khai trực tiếp vào chỉ tiêu hoặc trên tờ khai mẫu số 01/GTGT của kỳ tính thuế phát sinh, như sau:
- Hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp: Khi thanh toán cho các giao dịch từ 5 triệu đồng trở lên chưa có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt trước đó, kê khai điều chỉnh giảm thuế GTGT đầu vào vào chỉ tiêu của kỳ phát sinh thanh toán.
- Phát hiện sai sót thuế GTGT đầu vào: Các sai sót làm tăng/giảm số thuế còn được khấu trừ hoặc giảm số thuế phải nộp được kê khai trực tiếp vào chỉ tiêu hoặc của kỳ phát hiện.
- Hóa đơn điều chỉnh, thay thế: Khi nhận được hóa đơn điều chỉnh hoặc thay thế, người mua kê khai trực tiếp vào chỉ tiêu hoặc của kỳ tính thuế nhận hóa đơn.
- Kế thừa số thuế GTGT còn được khấu trừ: Trong các trường hợp chuyển đổi doanh nghiệp, sáp nhập, chia tách hoặc chấm dứt hoạt động đơn vị phụ thuộc, người nộp thuế kê khai theo thông báo bàn giao mà không cần khai bổ sung.
- Hóa đơn đầu vào bỏ sót chưa kê khai: Phát hiện hóa đơn đầu vào bỏ sót từ các kỳ trước được phép kê khai vào chỉ tiêu của kỳ hiện tại theo quy định thay vì lập hồ sơ khai bổ sung cho kỳ cũ.
2.Các trường hợp được khai bổ sung hồ sơ khai thuế:
Căn cứ khoản 5 Điều 12 Luật Quản lý thuế 2025, các trường hợp được khai bổ sung hồ sơ khai thuế từ 01/7/2026, như sau:
- Trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra;
- Hồ sơ không thuộc phạm vi, thời kỳ thanh tra, kiểm tra thuế, khoản thu khác nêu tại quyết định thanh tra, kiểm tra;
- Hồ sơ không thuộc trường hợp cơ quan điều tra yêu cầu không được khai bổ sung hồ sơ khai thuế, khoản thu khác để phục vụ điều tra vụ án;
- Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp còn sai, sót liên quan đến phạm vi, thời kỳ đã thanh tra, kiểm tra dẫn đến phát sinh tăng số thuế phải nộp, giảm số thuế đã được miễn, giảm, hoàn, giảm số thuế được khấu trừ, giảm số thuế đã nộp thừa thì người nộp thuế được bổ sung hồ sơ giải trình với cơ quan thuế;
- – Các trường hợp thực hiện theo kết luận, quyết định của cơ quan nhà nước có thẩm quyền liên quan đến nội dung xác định nghĩa vụ thuế của người nộp thuế.
Trường hợp người nộp thuế khai bổ sung làm tăng số thuế phải nộp, giảm số thuế được khấu trừ, miễn, giảm, hoàn thì bị xử lý theo quy định như đối với trường hợp cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền thanh tra, kiểm tra phát hiện
3.Các trường hợp không được khai bổ sung hồ sơ thuế:
– Đang thuộc phạm vi và thời kỳ bị thanh tra, kiểm tra thuế
Chỉ cho phép khai bổ sung khi chưa công bố quyết định thanh tra, kiểm tra hoặc hồ sơ đó không thuộc phạm vi, thời kỳ thanh tra, kiểm tra.
Nếu sau đó phát hiện sai sót làm tăng số thuế phải nộp, giảm số thuế được miễn, giảm, hoàn, khấu trừ thì được nộp hồ sơ giải trình bổ sung và vẫn bị xử lý như trường hợp cơ quan thuế phát hiện.
– Cơ quan điều tra có yêu cầu không được khai bổ sung
Nếu cơ quan điều tra có yêu cầu không cho khai bổ sung hồ sơ thuế để phục vụ điều tra vụ án thì người nộp thuế không được khai bổ sung trong thời gian yêu cầu đó còn hiệu lực.
– Hết thời hạn 5 năm
Trong thời hạn 05 năm kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ của kỳ tính thuế có sai sót thì mới được khai bổ sung hồ sơ khai thuế.
4.Hồ sơ khai bổ sung hồ sơ khai thuế năm 2026, gồm:
5.Thời hạn nộp hồ sơ khai bổ sung hồ sơ khai thuế
Căn cứ khoản 5 Điều 12 Luật Quản lý thuế 2025 quy định khai bổ sung hồ sơ khai thuế: Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai, sót thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế trong thời hạn 05 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế.
Lưu ý: Người nộp thuế có nghĩa vụ lập và nộp hồ sơ khai bổ sung đúng mẫu khi phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp có sai sót, đồng thời nộp đủ số tiền thuế còn thiếu, tiền chậm nộp (nếu có) vào ngân sách nhà nước khi việc bổ sung làm tăng số tiền thuế phải nộp hoặc giảm số tiền thuế được khấu trừ/hoàn trả và chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của số liệu điều chỉnh.
Hồ sơ khai bổ sung hồ sơ khai thuế năm 2026 được thực hiện theo quy định tại Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15, Nghị định số 252/2026/NĐ-CP và hướng dẫn chi tiết tại Thông tư 89/2026/TT-BTC.
Để kịp thời phát hiện sai sót trong thời hạn 05 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ của kỳ tính thuế có sai sót và trước khi cơ quan thuế hoặc cơ quan nhà nước có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra. Người nộp thuế nên thường xuyên rà soát nội bộ tự kiểm tra lại hồ sơ chứng từ, hóa đơn điện tử và tờ khai thuế hoặc thuê dịch vụ tư vấn thuế độc lập rà soát chuyên sâu toàn diện để tránh rủi ro phạt nặng về gian lận, trốn thuế hoặc chậm nộp.
VLK Group luôn sẵn sàng hỗ trợ doanh nghiệp tư vấn, rà soát, đánh giá rủi ro và tìm phương án khắc phục, điều chỉnh số liệu phù hợp với thực tế và quy định của pháp luật trước khi cơ quan thuế vào kiểm tra trực tiếp.